殺菌方式主要有三種:

 1、熱水循環式殺菌:殺菌時鍋內食品全部被熱水浸泡，這種方式熱分布比較均勻。

 2、蒸汽式殺菌:食品裝到鍋里后不是先加水，而是直接進蒸汽升溫，由于在殺菌過程中鍋內存在空氣會出現冷點，所以這種方式熱分布不是均勻。

 3、淋水式殺菌:這種方式是采用噴嘴或噴淋管將熱水噴到食品上，殺菌過程是通過裝設在殺菌鍋內兩側或頂部的噴嘴中，噴射出霧狀的波浪型熱水至食品表面，所以不但溫度均勻無死角，而且升溫和冷卻速度迅速，能全面、快速、穩定的對鍋內產品進行殺菌，特別適合軟包裝食品的殺菌。

    對于壓力的控制，主要是依據產品的包裝材料來決定的，即不同的包裝材料，會有不同的壓力控制要求（例如火腿腸、玻璃瓶、馬口鐵罐頭、三片罐、兩片罐、PE瓶、PET瓶、塑料盒、真空包裝、鋁箔盒、含氣包裝袋等）。